新生儿囟门凹陷可能是正常的生理现象、缺钙、脱水等原因引起，需要根据病因对症治疗。
1、生理现象：新生儿刚出生时，骨骼还没有完全的发育好，在出生时可能会出现囟门凹陷，通常还会伴随着局部有跳动感，属于正常的生理状况。
2、缺钙：新生儿生长发育需要大量的钙质吃，缺乏钙质和维生素等原因可能会影响正常的囟门闭合，也会导致囟门出现凹陷。
3、脱水：新生儿呕吐和腹泻比较严重可能会引起脱水，导致体内的营养流失，出现囟门凹陷的症状。
除此之外，还有可能是重度营养不良造成的，需要及时调理喂养方式，必要时可通过药物补充。
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