巴氏腺囊肿基本上都是在做完常规检查后才可以知晓，如果是没有任何病变的迹象，或者是患者没有感觉到什么症状表现就可以不去采取治疗，只要是定期去医院做复查就可以，但是如果是在检查的时候已经发现自己的囊肿有扩大可能性，已经影响到正常生活，就需要采取手术来介入治疗。
由于该囊肿可以长期存在，多年不变，定期观察，无需治疗。如果囊肿逐渐长大，影响生活，或反复感染，经常形成脓肿，可行巴氏腺囊肿造口术。此法简单，损伤小，尚能保留腺体功能。但造口应够大，造口之后最好放引流条，每天用双氧水或者2%碘伏冲洗一次，共3～4次，防止术后粘连闭合，再次形成囊肿。一旦脓肿形成，应当切开引流。
近年来采用CO2激光做造口术治疗，治疗率高，无不良反应，操作简便，治疗时间短，无需缝合创面，病人可在门诊治疗；由于激光的高热效应能使组织细胞凝固、炭化，因激光对血红蛋白有亲和力，故有较好的凝血作用，术中及术后出血少，能保留腺体的正常功能，对性生活无影响，术后无感染，无需用抗生素。但此种技术应用范围尚不广泛，有待进一步观察研究。
前庭大腺囊肿大小不一，多由小逐渐增大，有些可持续数年不变。若囊肿小且无感染，患者可无自觉症状；若囊肿大，患者可感到外阴有坠胀感或有性交不适。检查见囊肿多为单侧，也可为双侧，囊肿多呈椭圆形。
前庭大腺囊肿系因前庭大腺管阻塞，分泌物积聚而成。在急性炎症消退后腺管堵塞，分泌物不能排出，脓液逐渐转为清液而形成囊肿，腺腔内的黏液浓稠或先天性腺管狭窄排液不畅，也可形成囊肿。亦可因前庭大腺损伤，如分娩时会阴与阴道裂伤后瘢痕阻塞腺管口，或会阴侧切开术损伤腺管。
