1.调整饮食
详细了解病人的饮食习惯及其与症状的关系，避免敏感食物，避免过量的脂肪及刺激性食物如咖啡、浓茶、酒精等，并减少产气食物(奶制品，大豆，扁豆等)的摄取。高纤维素食物(如麸糠)可刺激结肠运动，对改善便秘有明显效果。
2.心理和行为治疗
对病人进行耐心的解释工作，具体包括心理治疗，生物反馈疗法等，对于有失眠，焦虑等症状者，可适当予以镇静药。
3.药物治疗
(1)解痉剂目前使用较为普遍的是选择性肠道平滑肌钙离子通道拮抗剂，或离子通道调节剂。抗胆碱能药如阿托品、颠茄、莨菪碱类也能改善腹痛症状，但需注意不良反应。
(2)通便剂便秘可使用导泻药，可试用容积性泻剂如甲基纤维素和渗透性轻泻剂如聚乙二醇、乳果糖等。刺激性泻剂应慎用。
(3)止泻剂如洛哌丁胺或复方苯乙哌啶等，可改善腹泻，需注意便秘、腹胀等不良反应。轻症者可选用八面体蒙脱石等吸附剂。
(4)促动力剂适用于有腹胀和便秘型患者。常用的有西沙比利或莫沙必利等。
(5)内脏止痛剂生长抑素及其类似物如奥曲肽，具有缓解躯体和内脏疼痛的作用。5-HT3受体阻滞剂如阿洛司琼，能改善腹泻型患者的腹痛及大便次数，可引起缺血性结肠炎等不良反应，使用时需注意。5-HT4受体的部分激动剂因其存在增加心血管缺血事件的风险，已被停止使用。
