头皮毛孔堵塞的原因主要包括皮脂腺分泌旺盛、内分泌失调以及头皮屑过多等，具体原因因人而异。
1、皮脂腺分泌旺盛：如果皮脂腺分泌比较旺盛又不注意头皮皮肤清洁卫生，脂腺分泌物就会在头皮皮肤上堆积，甚至导致毛孔堵塞，要养成勤洗头的习惯，保持皮肤清洁卫生。
2、内分泌失调：长期作息不规律或压力太大等原因诱发内分泌失调的情况时，可能会导致雌激素分泌过多，从而导致毛囊口角质化，导致毛囊腔变小，甚至使毛孔堵塞，要养成规律的作息习惯，保持心情舒畅。
3、头皮屑过多：如果平时头皮屑过多又不及时清洁皮肤，也有可能造成毛孔堵塞的情况，可以选择有去屑作用的洗发水洗头。
除了以上原因外，致异性脱发或细菌感染等原因，也可能会造成头皮毛孔堵塞的情况，需要到医院皮肤科做进一步的检查并对症治疗。
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