雾化吸入是一种在临床医学中应用比较广泛的治疗方式，主要是用于治疗呼吸道疾病的。虽然是一种治疗手段，但这并不代表雾化吸入就是安全的，如果在治疗的过程中，吸入量过多，或者吸入的速度过快，都会导致支气管痉挛、急性肺水肿、气管阻塞、呃逆、真菌感染等并发症。
1. 支气管痉挛
主要是由于吸入速度过快或吸入量过大所致。由于过多的气溶颗粒快速进入支气管和肺泡，形成过饱和的雾液，从而刺激支气管平滑肌而引起支气管痉挛，患者出现胸闷、气短、心悸、喘息等支气管阻塞症状。
2. 急性肺水肿
急性肺水肿的发生主要与雾化吸入量大、持续时间长有关，这使得大量雾滴持续进入肺泡内。雾滴中含有大量水分，可在肺泡表面形成张力。一旦这种张力大于肺泡表面活性物质的张力，就会引起肺泡萎缩，导致毛细血管内的水分渗透进入肺泡和肺间质中，从而引起急性肺水肿，患者出现频繁咳嗽，咳出大量泡沫样痰，以及呼吸困难等一系列症状和体征。
3. 气管阻塞
气管阻塞多发生在体质虚弱的幼年或老年患者身上。幼年患者咳嗽无力，因而往往会出现咳痰不利，导致支气管内常有黏痰滞留，特别容易造成幼儿纤细的支气管受到阻塞。对老年患者来说，长时间使用低渗雾化液，很有可能造成痰液膨胀而阻塞细小支气管，形成小气管阻塞，呼气困难，从而加重老年患者的缺氧状态，出现呼吸困难、发绀和心律失常等临床表现。
4. 呃逆
呃逆多见于雾化吸入速度过快、过猛时，大量气雾颗粒被吞入，刺激膈肌导致膈肌不自主、间歇性的痉挛，临床表现为呃逆（打嗝）不止。
5. 真菌感染
长期雾化吸入广谱抗生素和糖皮质激素等药液，可致正常机体免疫功能下降，或引起呼吸道的菌群失调，使得各类真菌，特别是白色念珠菌、肺孢子菌、曲霉菌等活跃起来，大量繁殖，从而引起呼吸系统的真菌感染（如肺部真菌感染、鹅口疮等）。肺部真菌感染的典型表现为咳嗽、咳痰和气喘，其痰液黏稠，呈胶冻状或可抽出长丝，并可伴有咯血或痰中带血。
鹅口疮的典型表现为口腔黏膜表面覆盖白色乳凝块样小点或小片状物，可逐渐融合成大片，强行剥离后局部黏膜潮红，可有溢血，但不痛，不流涎，不会影响正常进食，无全身症状。
