黄连素是一种比较常见的药物，能够治疗多种疾病，但任何药物都是有副作用的，黄连素也不例外，如果长时间使用这种药物的话会给身体健康带来影响，比如会导致肠胃功能下降。
一、长期大量服用黄连素的副作用
首先是导致肠道PH值(酸碱度)的改变，影响肠道消化酶的活性。
其次渗透压高，长期服用某些药物将刺激肠道蠕动速度加快，食物靡团和肠道接触的有效时间减少，减短了吸收营养物质的时间。
第三是药物对肠道益生菌(正常菌群)的活性，有抑制作用，长期服用某些药物，会破坏人对维生素族及脂肪酸的吸收，而导致各种系统出现疾病。
二、黄连素的其他主要副作用
味苦。剂量过大时对胃有一定刺激，可使胃酸过多，即中医所说“苦败胃”。
黄连素对心率的影响与剂量及给药方式有关，每日口服2克以下，对心率无影响；如静脉点滴，可抑制心脏传导系统，引起心率减慢。所以，临床上为了避免副作用的发生，对于溃疡病者，可饭后服药，或将每次剂量适当减少至0.3克；一般不静脉给药，口服剂量不要随意加大，最好不要超过2克。
黄连素的降血糖作用明显，且呈量效关系。但专家指出，服用黄连素降血糖副作用较大，有一定风险，不宜长期大量服用。其主要副作用可能就是横纹肌溶解症及乳酸中毒症。
黄连素最常见的副作用是便秘，大量应用后偶有恶心、呕吐、皮疹及发热，停药后即可消失。
三、服用黄连素注意事项
1.妊娠期头3个月慎用。
2.对本品过敏者禁用，过敏体质者慎用。
3.本品性状发生改变时禁止使用。
4.请将本品放在儿童不能接触的地方。
5.儿童必须在成人监护下使用。
