并发症可见胃肠炎、心肌炎、间质性肺炎、急性脊髓神经根炎、呼吸麻痹等。
埃可6、9、25~32型病毒可引起流行性胸痛;埃可1~8、11~34型病毒引起可引起非特异性发热;埃可1、4、6、8、9、14、19、22、25、30型病毒可引起急性心肌炎和心包炎; 埃可4、7、20和25型病毒可引起流感样症状表现;19、20型病毒可引起肺炎;9型病毒在成人中可引起支气管肺炎;埃可1~4、6、7、9、11、14、16、18、19、30型病毒皆可引起类似于脊髓灰质炎的瘫痪性疾患;埃可2~4、6、7、9、11、14、16、18、19和30型病毒均可引起脑炎症状类似于乙型脑炎。