儿童糖尿病极易被误诊。主要是因为儿童糖尿病患者“三多一少”(多尿、多饮、多食及消瘦)的症状不容易被人发现，而且有发热、呼吸困难、精神不振为首发症状的糖尿病多见于小儿，常被误诊为上呼吸道感染、支气管炎、中枢神经系统感染等。同时，以腹痛、腹泻为首发症状的糖尿病发病急，常被误诊为肠炎、急性阑尾炎等，使病情难以得到及时的遏制，贻误病情。
临床上有一些疾病容易与小儿糖尿病相混淆，所以，鉴别诊断也是不容忽视的步骤。
对比其他的泌尿系统、消化系统，各个其他系统的疾病，小儿糖尿病本身，血糖、尿糖同时增高，做OCTT，会出现I型和II型糖尿病的特点。
对比继发性糖尿病，比如说肾性糖尿病，肝性糖尿病，或者是休克，等等急性代谢紊乱期的血糖增高，会有一些基础疾病，在基础疾病的基础上，发生血糖应激性的增高，这种应激性的增高，随着原发病的好转，会很快下降。在代谢紊乱期控制几天以后，等到原发病一好转，胰岛素就可以停用，所以它就不是糖尿病的典型表现。
除此之外，小儿糖尿病还需要与婴儿暂时性糖尿病，进行鉴别诊断。对于仅有口渴，消瘦或遗尿症状的患儿;或有糖尿病家族史的患儿;或者出现不明原因的脱水酸中毒的患儿都要考虑到有小儿糖尿病的可能性，避免误诊。
具体需鉴别诊断的有：
1.儿童2型糖尿病 胰岛素抵抗为主伴胰岛素相对分泌不足，或胰岛素分泌不足伴或不伴胰岛素抵抗，属多基因遗传病，占小儿糖尿病总数8%左右，近年来发病率有增高趋势。多见于10岁以上儿童。肥胖、高胰岛素血症(hyperinsulinemia，黑棘皮病)及家族2型糖尿病史是导致儿童发生该型糖尿病的高危因素。约1/3患儿无临床症状，有时因肥胖就诊，给予糖耐量试验后才发现。一般无酮症酸中毒，但在应激情况下也会发生。血C肽水平正常或增高、各种自身抗体ICA、IAA、GAD均阴性。饮食控制、锻炼或口服降糖药治疗有效。
2.青少年型糖尿病(MODY) 为单基因遗传的常染色体显性遗传病，是一种特殊类型的非胰岛素依赖性糖尿病。临床特征是发病年龄小于25岁，有三代以上家族糖尿病史，起病后几年内不需要胰岛素治疗。至今发现MODY有5种类型及其相关基因。治疗同2型糖尿病。
3.新生儿暂时性糖尿病 与胰腺β细胞发育不全和酶系统功能不全有关。本症少见，可见于小于胎龄儿，往往母亲有糖尿病史。对胰岛素治疗较敏感。
4.肾性糖尿 患儿尿糖阳性而血糖正常，主要由于肾脏排泄葡萄糖功能异常所致。本症可见于范可尼综合征、近端肾小管功能障碍、良性家族性肾性糖尿等。
另外还要与其他可致尿糖阳性的疾病鉴别：如婴儿因严重感染、外伤而致暂时性糖尿。肾排糖阈值下降所致的肾性糖尿，甲状腺功能亢进时的糖尿等。
